دورات التعليم الإحترافية

‏إظهار الرسائل ذات التسميات مقالات. إظهار كافة الرسائل
‏إظهار الرسائل ذات التسميات مقالات. إظهار كافة الرسائل

الأحماض الأمينية و تصنيفها حسب السلسلة الجانبية

الأحماض الأمينية مركبات عضوية تتكون جميعها من جزئين:
- جزء ثابت:
و يضم وظيفة كربوكسيلية (حمضية) COOH و وظيفة أمينية (قاعدية) NH، ترتبط الوظيفتين على مستوى الكربون المركزي.
- جزء متغير: أي خاص بكل حمض أميني يدعى السلسلة الجانبية أو الجذر الألكيلي و يرمز له بالحرف (R). 

هناك عدة طرق لتصنيف الأحماض الأمينية أهمها تلك التي تعتمد عليى محتوى السلسلة الجانبية (الجذر الألكيلي) من مجموعات قاعدية أو حامضية ، وتقسم الأحماض الأمينية تبعا لذلك إلى  ثلاثة أقسام أساسية:
1- الأحماض الأمينية الحمضية: و هي التي تحتوي على وظيفة حمضية (COOH) إضافية في السلسلة الجانبية (الجذرR )، و تضم كل من الأسبارتيك Asp و الغلوتاميك Glu.

2- الأحماض الأمينية القاعدية: و هي التي تحتوي على وظيفة قاعدية (NH) إضافية في السلسلة الجانبية (الجذر R)، و تضم كل من الأرجنين Arg، الليزين Lys و الهستدين His.

3- الأحماض الأمينية المتعادلة: و هي التي لا تحتوي على أي وظيفة حمضية/قاعدية إضافية في السلسلة الجانبية (الجذر R)، و تضم باقي الأحماض الأمينية الخمسة عشر.

مستويات البنية الفراغية للبروتينات

تتميز البنية الفراغية للبروتينات بتعقديها و صعوبة تمثيلها بطريقة صحيحة لذا قسمت إلى مستويات بنائية متدرجة التعقيد، و هي كالتالي:
- البنية الأولية: هي تتابع الأحماض الأمينية المرتبطة بروابط ببتيدية لتكوين سلسلة ببتيدية.

- البنية الثانوية: هي إلتفاف للسلسلة الببتيدية ذات البنية الأولية، لتشكل بنيات ثانوية: - بنية ثانوية حلزونية آلفا α - بنية ثانوية وريقات مطوية بيتا β.
- تحافظ البنيات الثانوية على تماسكها بواسط روابطة هيدروجينية تتشكل بين مجموعات CO ومجموعات NH.
- تحتوي هذه البنيات أيضا على مناطق بينية لا تأخذ أشكال فراغية محددة تساهم في تشكل البنية الثالثية.

- البنية الثالثية: هي إنطواء السلسلة الببتيدية المحتوية على عدد من البنيات الثانوية و المناطق البينية، يحدث هذا الإنطواء في مستوى المناطق البينية لذلك تسمى مناطق إنعطاف، قد تحتوي البنية الثالثية على بنيات ثانوية آلفا فقط أو بنيات ثانوية بيتا فقط أو الإثنين معاً وذلك حسب نوع البروتين.
- تحافظ البنية الثالثية على استقراراها بوجود أربع أنواع من الروابط:
1- الروابط الهيدروجينية.
2- الروابط الشاردية (الملحية).
3- تجاذب الجذور الكارهة للماء.
4- الجسور الكبريتية الناتجة بين جذرين لحمضين أمينيين من نوع Cys.


- البنية الرابعية: هي تجمع لسلسلتين ببتديتين أو أكثر لكل منهما بنية ثالثية، حيث تسمى كل سلسلة بتحت وحدة، تتماسك تحت الوحدات فيما بينها غالباً بواسطة روابط ضعيفة (روابط هيدروجينية، شاردية و كارهة للماء).
مثال: بروتين الهيموغلوبين.


 

آلية تنشيط الأحماض الآمينية Aminoacyl-ARNt-Synthetase

 تسبق عملية الترجمة عملية تنشيط للأحماض الآمينية و هي عملية يتم فيها ربط الأحماض الأمينية بـ ARNt الخاص بها.
- العناصر اللازمة لتنشيط الحمض الأميني و دورها:
1- الإنزيم النوعي Aminoacyl- ARNt – Synthetase : يحتوي على موقعين احدها خاص بال  ARNt والآخر خاص بالحمض الاميني دوره تحفيز تفاعل ربط الحمض الأميني بالـ ARNt.
2-  الـ  ARNt يرتبط بالحمض الأميني الخاص به لنقله الى مقر الترجمة.
3- الـ  ATP توفر الطاقة اللازمة لعملية التنشيط.
- آلية تنشيط الحمض الأميني: يتوضع الحمض الأميني و الـ ARNt  النوعي الخاص به على موقعين خاصين في انزيم التنشيط، فيتشكل معقد بربط الحمض الأميني بالـ  ARNt مع استهلاك طاقة  باماهة ATP  الى AMP  ثم يتحرر المعقد ليتفرغ الانزيم لنشاط مماثل من جديد.





بنية و دور الـ ARNt

- يتكون الــ ARNt من سلسلة واحدة من متعدد النيكليوتيد تلتف لتأخذ شكل حرف L مقلوب أو على شكل ورقة نبات النفل.
- يحمل الـ ARNt موقعين: موقع لتثبيت الحمض الآميني و موقع الرامزة المضادة، أي ان كل ARNt  نوعي (خاص برامزة واحدة).
- دوره: تثبيت و نقل الأحماض الآمينية الى الريبوزومات أثناء عملية تركيب البروتين.



بنية و مكونات الريبوزوم | Ribosome structure

 الريبوزوم عضية تتكون من 3 انواع من الـ (ARNr (S23;S16;S5 و 52 نوع من البروتينات الخاصة، موزعة على تحت وحدتين بحيث:
- تحت الوحدة الريبوزومية الكبرى: تتركب من الـ  ARNr S23 و الـ ARNr S5 و 31 نوع من البروتينات، تحتوي على موقعين تحفيزيين (A وP) خاصين بارتباط الـ ARNt ( يمكن ان تستقر بهما جزيئتين في وقت واحد).
- تحت الوحدة الريبوزومية الصغرى: تتركب من الـ ARNr S16 و 21 نوع من البروتينات، تحمل موقع قراءة الـ ARNm.
- يكمن دور الريبوزم في الخلية في تركيب البروتين (ترجمة ARNm).
- ملاحظة: الموقع E هو موقع خروج الــARNt و ذلك بعد ربط الحمض الأميني الخاص به في السلسلة الببتيدية التي تكون في طور التشكل.
- قيم معامل ترسيب ARNr و عدد أنواع البروتينات خاصة بريبوزم بكتيريا  E. coli و هي تختلف من كائن إلى آخر.


https://www.snvdz.com/2020/12/snvcours.html